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NVIDIA助力對(duì)抗新冠病毒 DGX-2 AI超算尋找抗病毒藥物篩選效率從2個(gè)月提升到2天

工程師鄧生 ? 來(lái)源:快科技 ? 作者:憲瑞 ? 2020-02-29 10:02 ? 次閱讀
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NVIDIA日前表示,上海交通大學(xué)魏冬青教授的團(tuán)隊(duì)使用了5臺(tái)NVIDIA研發(fā)的DGX-2 AI超算用于尋找抗病毒藥物,篩選效率從之前的2個(gè)月提升到2天,而且發(fā)論文的數(shù)量也是之前的十多倍。

在對(duì)抗新冠病毒的過(guò)程中,尋找有效治療藥物是關(guān)鍵,現(xiàn)代藥物研發(fā)就需要超強(qiáng)的計(jì)算能力了,AI人工智能也是必不可少的。

魏冬青教授帶領(lǐng)研究團(tuán)隊(duì)選擇利用人工智能技術(shù)進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬,在現(xiàn)有小分子藥物(包括FDA已批準(zhǔn)的藥物)中篩選能夠?qū)π鹿诓《酒鸬揭种菩宰饔玫乃幬铮詫?shí)現(xiàn)老藥新用,進(jìn)而可以馬上進(jìn)行臨床應(yīng)用。

據(jù)魏教授介紹,在藥物篩選過(guò)程中,研究團(tuán)隊(duì)需要對(duì)幾十萬(wàn)種分子進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬計(jì)算,面對(duì)如此大規(guī)模的計(jì)算量,如按照目前常規(guī)的算力條件,團(tuán)隊(duì)需要1到2個(gè)月的時(shí)間才能完成全部模擬。

但是疫情面前,時(shí)間就是生命。最終魏教授的團(tuán)隊(duì)選擇了5臺(tái)NVIDIA的DGX-2人工智能超算用于此次的研究。

NVIDIA表示,DGX-2人工智能超級(jí)計(jì)算機(jī)是NVIDIA GPU計(jì)算和存儲(chǔ)能力的集大成者,其配置了16張NVIDIA Tesla V100 GPU, 可擴(kuò)展架構(gòu)使得模型的復(fù)雜性和應(yīng)用的規(guī)模不受傳統(tǒng)架構(gòu)局限性的限制,由多臺(tái)DGX-2組成的GPU集群更是可以輕松應(yīng)對(duì)數(shù)據(jù)科學(xué)各種復(fù)雜的AI和HPC挑戰(zhàn)。

NVIDIA表示,有了超高性能的計(jì)算資源助力,再配合先進(jìn)的醫(yī)學(xué)研究深度學(xué)習(xí)軟件,團(tuán)隊(duì)的藥物研究進(jìn)程得到了極大地提速,原本需要1到2個(gè)月才能完成的模擬計(jì)算,如今只用1到2天就完成了。

不僅工作效率大幅提升,NVIDIA還強(qiáng)調(diào)發(fā)表科研成果的速度變了,過(guò)去魏教授每三年發(fā)表的論文也就是4-5篇,最多不超過(guò)10篇。

借助于AI技術(shù)的廣泛應(yīng)用,現(xiàn)在魏教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)在3年的時(shí)間里發(fā)表了90余篇論文成果,科研進(jìn)程相比于過(guò)去有了極大的提速。

詳細(xì)情況可以參考NVIDIA官方發(fā)表的博文——超強(qiáng)DGX-2加速抗新冠病毒藥物研究,助力打贏抗 “疫”戰(zhàn)

責(zé)任編輯:wv

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